|
单细胞测序技术与应用 |
1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。 2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。 3. 近年单细胞方向高分文章思路解析。 4. 单细胞组学和多组学整合分析思路和案例介绍。 |
|
R语言入门与实操 |
1. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用说明。 2. R语言语法介绍及常用命令。 3. 数据处理功能及统计应用。 4. R语言画图实操。 |
|
单细胞转录组数据分析思路及流程
|
1. 单细胞实验处理、建库及测序。 2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等分析思路。 3. 单细胞转录组转录因子及功能通路解析。 4. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物、微生物等领域的研究内容及思路。 |
|
单细胞转录组数据分析实操 |
1. 常规单细胞组学数据比对。 2. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操。 3. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操。 4. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维。 5. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。 6. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析。 |
|
多组学整合分析和结果解读 |
1. 转录组，基因组，表观分析介绍。 2. RNA和 ATAC-seq等多组学整合分析。 3. 常规10X单细胞ATAC数据测序原理简介、分析流程介绍。 4. 单细胞免疫组库测序技术及应用。 5. 组学分析常用数据库介绍及使用。 |
|
单细胞转录组轨迹、通路、转录因子等分析及绘图实操 |
1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析。 2. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析。 3. 通过SCENIC软件进行转录因子预测分析。 4. tSNE，小提琴图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制。 |