SCI数据库的论文被引用的频率通常更高。这主要基于以下几个方面的考虑：

1. 影响因子：SCI数据库中的期刊通常会公布其影响因子（Impact Factor），这是一个衡量期刊论文被引用频率的重要指标。影响因子是指某期刊前两年发表的论文在当年被引用的平均次数。一般来说，SCI期刊的影响因子普遍较高，这意味着其论文被引用的频率也相对较高。
2. 学科覆盖范围：SCI数据库涵盖了自然科学、医学、社会科学等多个学科领域，而EI则主要关注工程领域。由于SCI的学科覆盖范围更广，其论文被引用的机会也更多。例如，一些跨学科的研究成果可能同时在SCI和EI上发表，但在SCI中更容易被其他领域的研究者引用。
3. 论文质量和创新性：SCI期刊对论文的学术质量和创新性要求较高，经过严格的同行评审和筛选。这些高质量的论文往往具有更高的学术价值和实践意义，因此更容易被其他研究者引用。相比之下，EI期刊虽然也要求论文具有一定的学术质量，但其筛选标准可能相对较低。
4. 国际影响力：SCI数据库在国际上具有较高的知名度和影响力，许多知名学术期刊都属于SCI收录范围。这使得SCI期刊的论文更容易被国际同行所了解和引用。而EI虽然也在工程领域具有一定的国际影响力，但相对SCI来说稍显逊色。

综上所述，SCI数据库的论文被引用的频率通常更高。然而，这并不意味着EI数据库的论文质量低或没有价值。在选择投稿期刊时，研究者应根据自己的研究内容和目标来选择最适合的期刊。同时，被引用次数并不是衡量论文质量的唯一标准，还需要考虑其他因素如研究方法的创新性、实验设计的严谨性等。