建立论文评价体系是一个复杂而细致的过程，旨在确保科研工作的质量和创新性得到公正、客观的评价。

以下是对如何建立论文评价体系的详细分析：

1. 确定评价原则：评价体系应建立在科学、公正、客观、合理的基础上，突出创新性原则，将创新视为科研论文评价的最高标准。同时，还应考虑论文的学术价值、社会影响和应用前景等因素。

2. 构建评价指标：评价指标是评价体系的核心，应根据评价目的和学科特点来设计。常见的评价指标包括文章质量（如科学性、新颖性、深度和广度）、影响力（如引用次数、下载次数）等。此外，还可以根据具体需求设计其他指标，如研究方法的严谨性、数据分析的准确性等。

3. 选择评价方法：评价方法的选择对于评价结果的准确性至关重要。可以采用定性与定量相结合的综合评价方式，既考虑专家的专业判断，又引入科学的量化指标作为评判依据。例如，可以借鉴英国和挪威等国的相关模型，建立健全国家科研信息管理系统，为不同层次的科研管理人员提供基于绩效的研究资助活动决策支撑。

4. 完善同行评审机制：同行评审是科研评价的重要环节，应充分发挥同行专家的作用，提供正确专业的评审意见。同时，要建立评审专家评价信誉制度，避免以SCI论文相关指标代替专业判断，并严格遵守回避原则，以保证评价工作的客观公正。

5. 规范评价流程：评价流程的规范性对于保证评价结果的公正性和准确性至关重要。应对评价流程进行明确的规定，包括评价申请、材料提交、专家遴选、评审过程、结果公示等环节。同时，要对申报材料进行精简优化，不再填报SCI论文相关指标，并推行代表作评价。

6. 建立反馈与改进机制：评价体系应建立有效的反馈与改进机制，及时收集和处理评价过程中的问题和建议，不断优化评价指标和方法。同时，要对评价结果进行公示和接受监督，确保评价工作的透明度和公正性。

7. 注重实践检验：一个好的评价体系应在实践中进行检验和完善。可以针对不同学派、学者的相关研究内容进行集成整合，并在学科评估、期刊评估、论文评价或创新质量评估等实践中加以运用和实证，以不断完善评价体系。

综上所述，建立论文评价体系需要综合考虑多个方面，包括确定评价原则、构建评价指标、选择评价方法、完善同行评审机制、规范评价流程、建立反馈与改进机制以及注重实践检验等。通过这些措施的实施，可以建立一个科学、公正、客观、合理的论文评价体系，为科研工作的健康发展提供有力保障。