学术不端检测的缺点主要体现在以下几个方面：

1. 漏检现象

原因：学术不端检测系统可能存在漏检现象，即检测结果低于实际的文字重复率。这主要是由于文献资源收录的完整性和时效性有限，以及系统检测算法的局限性。例如，系统可能无法准确识别改变句子语态、翻译外文文献或改变图表模型后的学术不端行为。

影响：漏检可能导致一些学术不端行为未能被及时发现和纠正，从而影响学术研究的公正性和质量。

2. 误判和漏判

原因：系统虽然能够识别出提交论文与数据库文献间的重复内容，但不能自动判别目标论文与被重复文献之间的引证关系。因此，合理的引用有时会被误判为剽窃。

影响：基于重复率直接判定作者的剽窃行为是不够准确的，可能导致对作者的误判和不必要的争议。

3. 检测流程中的漏洞

现象：在部分院校中，论文查重通常安排在答辩之前，这之间存在一定的时间差。部分学生可能利用这一漏洞，在送检前删除抄袭内容，待论文检测合格后，再使用完整版本进行答辩。

影响：这种行为严重破坏了论文检测的严肃性，使得检测结果无法真实反映论文的实际情况。

4. 论文规范性问题

原因：为了降低重复率，学生可能采用同义词替代、改变句子语态、将文字转换为图表等手段对论文进行修改。

影响：这些修改可能导致论文语句不够通顺，影响论文的规范性和可读性。

5. 依赖技术手段过度

现象：检测部门过于依赖技术手段，可能忽视导师、编辑、评审专家等人在论文审查中的重要作用。

影响：这可能导致符合学术规范的论文因查重不准确而被误判，出现本末倒置、避重就轻的情况。

6. 浪费人力物力

现象：论文作者为了降低重复率，需要进行多次自我查重和修改，这浪费了大量时间和精力。同时，检测部门也需要投入大量资源进行查重检测。

影响：这可能导致作者无法专注于科学研究和论文写作本身，同时也增加了检测部门的工作负担。

7. 无法全面识别学术不端行为

原因：学术不端行为不仅限于抄袭剽窃，还包括伪造、篡改、不当署名、一稿多投、代写、买卖等多种行为。检测系统主要依赖于文字比对技术，难以全面识别这些行为。

影响：这使得检测系统在某些情况下无法有效遏制学术不端行为的发生。

综上所述，学术不端检测虽然在一定程度上能够预防和打击学术不端行为，但其缺点也不容忽视。为了更好地发挥检测系统的作用，需要不断完善其算法和数据库资源，并加强与其他审查手段的结合使用。