首先，知网查重系统是一个用于学术不端检测的软件，主要针对的是高校、学术期刊等机构的论文。其作用是对这些论文进行查重，防止学生或研究者抄袭或剽窃他人的研究成果。因此，知网查重系统主要针对的是公开发表的学术文献，而并非所有的毕业论文。

其次，知网查重系统在收录论文时，会进行一定的筛选和处理。例如，对于一些质量较低、内容重复度过高的论文，知网并不会进行收录。因此，即使某些毕业论文被提交到知网查重系统，也并不意味着它们一定会被收录进知网数据库。

此外，各高校和机构的具体规定不同，对于毕业论文的管理和存档方式也有所不同。有些高校可能会要求学生对毕业论文进行严格的保密，不会将其公开发表或提交给查重系统。因此，即使知网查重系统具有收录所有毕业论文的能力，实际上也并不一定会收录所有的毕业论文。

最后，需要注意的是，知网查重系统只是检测论文的重复性，并不会对论文的内容进行评估。因此，即使某些毕业论文被收录进知网数据库，也并不意味着它们的质量或学术价值就一定高。毕业论文的质量需要由学术界和相关机构进行评估和认可。

综上所述，知网查重系统并不会收录所有的毕业论文。它会针对学术文献进行查重检测，并有一定的筛选和处理机制。同时，各高校和机构对于毕业论文的管理和存档方式也有所不同，因此实际收录情况也会有所不同。