清华大学的学术期刊与多个机构有合作关系。以下是对这些合作机构的详细介绍：

1. 中国化学会：Nano Research由清华大学和中国化学会联合主办，主编为清华大学李亚栋院士和范守善院士。

2. 香港城市大学：Nano Research Energy由清华大学化学系曲良体教授和香港城市大学支春义教授共同担任主编。

3. 建筑设计研究院有限公司：清华大学（建筑学院）与建筑设计研究院有限公司共建了建筑协同创智联合研究中心。

4. 梅赛德斯奔驰（中国）投资有限公司：清华大学与梅赛德斯奔驰（中国）投资有限公司共同成立了可持续交通联合研究院。

5. 丰田汽车公司：清华大学－丰田联合研究院是清华大学与丰田公司成立的研究机构，在自动驾驶汽车人工智能技术、氢能与燃料电池汽车等领域开展研究。

6. 帝国理工学院：清华大学与帝国理工学院签署了战略科研合作协议，并启动了联合种子基金项目。

7. 耶鲁大学：清华大学携手北京大学、北京师范大学、华北电力大学和耶鲁大学等国内外多所高校和大型能源企业，共同参与“碳中和与能源智联”国际大科学计划。

8. 新南威尔士大学：清华大学与澳大利亚新南威尔士大学签订了战略科研合作协议，并设立了联合科研种子基金。

综上所述，清华大学的学术期刊通过与国内外知名高校、科研机构以及企业的紧密合作，不仅提升了自身的科研水平，也促进了学科建设和人才培养，增强了其在国际学术界的影响力和知名度。