纸质版论文查重通常需要先将纸质文档转换为电子版本，然后使用电子版本的论文查重系统进行检测。以下是具体步骤：

1. 扫描纸质文档：将纸质版论文通过扫描仪转换为电子版本，常见的格式有PDF、图片等。确保扫描质量足够高，以便后续处理。

2. 文字识别：使用光学字符识别技术对扫描后的电子文档进行处理，将图片或PDF中的文字内容识别并转换为可编辑的文本格式，如Word或TXT。

3. 校对和格式调整：OCR识别后的内容可能存在一些错误，需要人工校对和格式调整，确保文本的准确性和规范性。

4. 查重系统选择：选择合适的论文查重系统。根据论文的语言和需求选择合适的查重系统，如知网、万方、Turnitin等。

5. 提交论文：将转换后的电子版论文提交到选定的查重系统。通常需要上传论文文件，并按照系统要求填写相关信息。

6. 查重报告：查重系统会自动比对数据库中的内容，并生成查重报告。报告中会详细列出相似度较高的文本片段及其可能的来源。

7. 人工审核：根据查重报告，作者或相关人员需要对论文进行人工审核，判断是否存在抄袭或不当引用，并对论文进行必要的修改。

8. 修改论文：如果查重报告显示存在高相似度，作者需要对论文进行修改或补充引用，以确保论文的原创性。

9. 重新查重：在论文修改后，可能需要重新进行查重以确保所有问题都已解决。

10. 最终审查：在某些机构，如学校或期刊编辑部，可能会有专门的学术委员会或编辑团队对论文进行最终审查，以确保其符合学术道德和出版标准。

11. 记录保存：查重报告和相关文件通常会被保存一段时间，以备未来参考或审计。

12. 持续监控：即使论文已经发表或学位已经授予，某些机构也会对其进行持续监控，以防止未来可能出现的学术不端行为。

纸质版论文的查重过程与电子版论文相比，多了扫描和文字识别的步骤，但后续的查重流程基本相同。