如果您在论文中忘记删掉致谢和目录部分并已经提交给了查重系统，可以尝试以下解决方法：

　　1.与相关机构或编辑联系：如果您的论文尚未被处理，您可以联系相关机构、学校或期刊的编辑，并说明情况。他们可能会允许您重新提交已更正的版本。

　　2.提交纠正版本：如果您有机会重新提交论文，建议在纠正后的版本中将致谢和目录部分删除，并确保只包含正文和引用的内容。确保在重新提交之前，仔细审查整个论文，以确保没有其他错误或遗漏。

　　3.解释原因：如果已经提交给了查重系统并无法更改，您可以与相关人员解释发生的错误并说明原因。提供一个解释性的附加说明，说明致谢和目录部分是无意间被遗漏的。

　　无论采取哪种解决方法，保持与相关人员的沟通和透明度非常重要。尽早发现并解决问题，以确保论文的完整性和准确性。同时，以后在提交论文之前，务必经过仔细的审查和校对，以确保所有不需要的部分都被删除，只保留论文的正文和相关引用。