论文中注释和参考文献的区别有以下几点

1.参考文献是引用人家已发表的观点或者文章或者实验结果等，需要在引用的那段话后面加[1][2]这样的上标，然后文章末尾列“参考文献”时与文中的上标相对应。参考文献有以下五个方面的作用：

①著录参考文献可以反映论文作者的科学态度和论文具有真实、广泛的科学依据，也反映出该论文的起点和深度。

②著录参考文献能方便地把论文作者的成果与前人的成果区别开来。

③著录参考文献能起索引作用。

④著录参考文献有利于节省论文篇幅。

⑤著录参考文献有助于科技情报人员进行情报研究和文摘计量学研究。

2.脚注，是汉语词汇，汉语拼音为就是可以附在文章页面的最底端的，对某些东西加以说明，印在书页下端的注文。脚注和尾注是对文本的补充说明。脚注一般位于页面的底部，可以作为文档某处内容的注释；尾注一般位于文档的末尾，列出引文的出处等。脚注一般是写作者的个人信息，例如作者，哪里人等信息或通讯作者的信息，这篇发表的这篇文章是哪个项目或者基金的组成部分。

3.注释就好像我们上语文课学古诗词时，那一页的下方有一些难理解词汇或者短剧的解释一样。注释是对书籍或文章的语汇、内容、背景、引文作介绍、评议的文字。为古书注释开始于先秦时期。中国古代分得较细，分别称之为注、释、传、笺、疏、章句等。