当前位置:首页 >> 学术资讯 >> 科研信息

生命学院颉伟课题组合作揭示人类早期胚胎翻译组图谱并发现人类合子基因组激活关键因子

2024/04/23

 在哺乳动物卵子向早期胚胎转变的过程(oocyte-to-embryo transition, OET)中,翻译在减数分裂、合子基因组激活和早期胚胎发育过程中扮演了一个重要的角色。合子基因组激活(human zygotic genome activation,ZGA)作为生命起始时的第一次转录事件和启动胚胎发育进程的关键事件,在哺乳动物中仍未被完全理解清楚。尽管启动ZGA的关键转录因子在其他物种,如斑马鱼和果蝇等中被陆续发现,启动人类ZGA的关键转录因子仍然是一个未解之谜。

通过结合超灵敏翻译组测序技术Ribo-lite(Ligation-free,ultra-low-InpuT and Enhanced Ribo-seq)和转录组测序技术(Smart-seq2)而开发出的Ribo-RNA-lite(R2-lite)方法可以进行翻译组与转录组联合测序,该方法被应用于人类卵子和早期胚胎共8个时期。清华大学生命学院颉伟教授课题组与其合作者经翻译组分析比较发现,在卵子向早期胚胎转变过程中,人-鼠同源基因中有一半呈现保守的翻译水平动态变化趋势,而另一半呈现不同的翻译水平动态变化趋势,例如编码表观遗传重编程因子、小RNA生物学合成酶等基因。并且这种物种特异性的翻译变化是部分由于(3’ UTR)的关键调控序列,例如胞质多聚腺苷酸化元件(cytoplasmicpolyadenylation element,CPE)和多聚腺苷酸化信号位点(polyadenylation signal site,PAS)的差异排布导致的。

人类早期胚胎翻译组数据还显示出一组Homeobox转录因子在人类合子基因组激活阶段附近呈现高翻译活性,并且它们潜在的DNA结合基序(motif)在ZGA基因的远端开放染色质区域(即可能的增强子)上高度富集。这些转录因子包括母源因子TPRXL以及在初级ZGA时期(minor ZGA)开始表达的TPRX1和TPRX2。TPRXL的3’ UTR上也带有CPE调控元件,在卵子减数分裂恢复时开始翻译上调。TPRX1/2/L联合敲低(TPRXtriple KD or TKD)将导致胚胎发育和ZGA的明显缺陷,大约31%的ZGA基因将被下调,并且这些基因富集PRD-like转录因子结合基序。TPRX1/2/L联合敲低胚胎中表达水平下调的基因包括有多个下游转录因子如ZSCAN4,DUXB,DUXA,NANOGNB,DPPA4,GATA6,DPRX,ARGFX以及KLF5。在人类胚胎干细胞中,过表达TPRX1/2也可以结合并激活一部分ZGA基因,说明TPRX1/2/L可以通过靶向下游转录因子从而启动下游转录事件。综上所述,这项研究不仅揭示了人-鼠早期胚胎翻译组动态变化的差异性和保守性以及可能原因,也鉴定出了人类合子基因组激活的关键调控因子TPRXL, TPRX1,和TPRX2。

人类卵子和早期胚胎翻译组与转录组联合测序揭示翻译调控机制和合子基因组激活关键因子

该文章于9月8日在《科学》(Science)期刊以长文形式发表,题为“翻译组与转录组联合图谱发现TPRXs参与人类合子基因组激活”(Translatome and transcriptome co-profiling reveals a role of TPRXs in human zygotic genome activation)。

清华大学颉伟教授、山东大学陈子江院士与赵涵教授为本文的共同通讯作者,清华-北大生命科学联合中心2018级博士研究生邹卓宁、山东大学生殖医学研究中心2021级博士研究生张传鑫、清华大学生命学院2020级博士研究生王秋艳以及山东大学生殖医学研究中心助理研究员侯真真为本文共同第一作者。

该课题得到了山东大学生殖内分泌教育部重点实验室、国家辅助生殖与优生工程技术研究中心、清华大学实验动物中心、清华大学高性能计算平台的大力支持。该研究获得了国家自然科学基金、国家重点研发计划、中国医学科学院配子发生与ART后代健康研究室项目、上海高水平地方高校创新研究团队项目、清华北大生命科学联合中心、北京市科学技术委员会以及美国霍华德休斯医学研究所国际研究学者(HHMI International Research Scholar)的经费支持。


版权声明:
文章来源清华大学新闻,分享只为学术交流,如涉及侵权问题请联系我们,我们将及时修改或删除。

相关学术资讯
近期会议

2025年清洁能源、电力系统与可持续发展国际会议(CEPSSD 2025)(2025-10-28)

2025年电力系统与电器工程国际会议(ICPSEE 2025)(2025-10-29)

第八届电力电子与控制工程国际学术会议 (ICPECE 2025)(2025-11-14)

2025年第四届计算与人工智能国际会议(ISCAI 2025)(2025-11-14)

2025年设计、数字媒体与多媒体技术国际会议(DDMMT 2025)(2025-11-20)

2025年IEEE电路与系统前沿技术国际会议(FTCS 2025)(2025-11-21)

第一届光电材料与电子信息工程国际学术会议 (OMEIE 2025)(2025-11-21)

2025年船舶、海洋工程与应用技术国际会议(ICSOEAT 2025)(2025-11-24)

第二届自动化、电气控制系统与设备国际学术会议(AECSE 2025)(2025-11-28)

第五届肿瘤治疗与转化医学国际研讨会(CTTM 2025)(2025-11-28)

2025绿色能源、气候变化与节能环保产业国际会议(CCECEP 2025)(2025-11-17)

2025年智慧气象、遥感技术与地理信息国际学术会议(SMRSTGI 2025)(2025-12-5)

2025年图书馆学、历史学与文化学国际会议(ICLSHCS 2025)(2025-12-13)

2025飞行技术、航海技术与轮机工程国际会议(FTNTME 2025)(2025-11-11)

2025文化产业、媒体发展与传播国际会议(ICCIMDC 2025)(2025-12-4)

2025年数字健康与远程医疗国际学术会议(ICDHD 2025)(2025-11-24)

2025电力、电网与绿色能源国际会议(ICEGGE 2025)(2025-11-11)

2025环境能源、电气科技与低碳发展国际会议(EEETLCD 2025)(2025-11-17)

2025年生物医学工程与智能器械国际会议(BEID 2025)(2025-12-24)

2025年教育、语言与艺术文化国际会议(ICELAC 2025)(2025-12-27)

小贴士:学术会议云是学术会议查询检索的第三方门户网站。它是会议组织发布会议信息、众多学术爱好者参加会议、找会议的双向交流平台。它可提供国内外学术会议信息预报、分类检索、在线报名、论文征集、资料发布以及了解学术资讯,查找会服机构等服务,支持PC、微信、APP,三媒联动。