《海洋与湖沼》学报是水科学领域最早、最有影响力的综合性学术刊物之一。期刊以报道基础和应用基础研究成果为主，特别重视刊载有影响的重要技术研发成果论文。内容涉及广泛，主要发表江河湖海、沼泽湿地等水科学领域的高端科技论文，学科涵盖生物、物理、化学、地质等多个学科及其分支。

《海洋与湖沼》是一级学报类学术期刊，在国际、国内水科学领域具有广泛影响。现已收录本刊的国内外重要数据库有：《中文核心期刊目录总览》（北大核心）、中国科学引文数据库（CSCD）、中国期刊全文数据库、中国科技论文引文统计分析数据库、中国学术期刊综合评价数据库、Scopus数据库、美国《化学文摘》（CA）、英国《科学文摘》（SA）、联合国《水产科学和渔业文摘》（ASFA）等。