合法期刊的出版流程包括多个阶段，从申请创办期刊到最终出版发行，每个环节都受到严格监管。以下是具体流程：

1. 申请创办期刊：创办期刊需具备特定条件，如不重复的名称、主办单位、30万元以上的注册资本等。中央或地方单位的期刊申请需经主管单位审核后报新闻出版总署审批。
2. 审批登记注册：申请被批准后，主办单位必须在60日内办理登记手续，包括领取《期刊出版许可证》和营业执照。
3. 编辑审稿过程：作者提交稿件后，编辑助理进行初步检查，然后由期刊主编评估是否符合标准，符合的稿件将送同行评审。评审意见返回后，编辑决定接收、拒稿或要求修改，作者需回应所有评论并重新提交。
4. 排版校对出版：接收的文章送至编辑加工部门排版编校，然后由作者校对。校对完成后，文章进入在线出版阶段，并获得DOI号码以供引用。
5. 发行监督管理：期刊分为公开发行和内部发行，公开发行期刊可向ISSN中国国家中心申领国际标准连续出版物号。国家新闻出版广电总局负责全国期刊出版活动的监督管理，确保期刊符合出版条例和法律法规。

总之，合法期刊的出版流程涉及严格的申请、审批、编辑、排版和监督管理环节，以确保期刊符合国家标准并传播高质量的学术成果。