当前位置:首页 >> 学术资讯 >> 科研信息

我国学者在样本间基因组结构变异差异分析方面取得进展

2025/06/02

我国学者在样本间基因组结构变异差异分析方面取得进展


图 基于“序列-图像”转换策略的样本间基因组结构变异差异比较算法SVision-pro框架图。在信息编码模块中,多样本基因组精细比较信息从序列空间转换到图像空间;在差异识别模块中,通过深度学习分割图像空间元素,直接识别样本间基因组结构变异精细差异

  在国家自然科学基金项目(批准号:32125009、32070663)等资助下,西安交通大学叶凯教授团队在样本间基因组结构变异差异鉴定方面取得进展。相关研究成果以“采用SVision-pro检测新发结构变异和体细胞结构变异(De novo and somatic structural variant discovery with SVision-pro)”为题,于2024年3月22日发表在《自然•生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。论文链接:https://www.nature.com/articles/s41587-024-02190-7。

  样本间基因组结构变异差异鉴定对于遗传疾病诊断、优生优育以及癌症等复杂疾病的诊断、治疗和机制研究具有重要意义。为了解决传统多样本比较策略假阳性高、临床实践难实施这一难点问题,叶凯教授团队提出了基于“序列-图像”转换策略的多样本差异比较算法SVision-pro(图)。该算法突破了传统“先检测再求差”的策略,将基因组结构变异的检测和分型问题从序列问题统一转化为图像空间的变异实例分割问题,通过直接比较图像化的样本测序差异,实现了高精确性、低假阳性的新发结构变异和体细胞结构变异的精准识别。

  叶凯教授团队长期致力于基因组结构变异的精细解析研究,并于2022年在《自然·方法》(Nature Methods)杂志上发表算法SVision,将“序列-图像”转换策略引入到单样本基因组结构变异检测领域,并解析了不同人种在神经发育基因上的复杂结构变异。基于“序列-图像”转换策略的SVision系列方法的提出为后续从大规模疾病队列数据和临床诊断数据中发现关键致病基因组结构变异提供了重要的技术支撑。


版权声明:
文章来源国家自然科学基金委员会,分享只为学术交流,如涉及侵权问题请联系我们,我们将及时修改或删除。

相关学术资讯
近期会议

2026年矿产资源、勘探技术与地球科学国际会议(ICRTS 2026)(2026-02-28)

2026年能源、电力与可持续发展国际学术会议(EESD 2026)(2026-03-06)

第三届光电信息与光学工程国际学术会议(OIOE 2026)(2026-03-06)

第九届大数据与应用统计国际学术研讨会(ISBDAS 2026)(2026-03-06)

第五届网络安全、人工智能与数字经济国际学术会议(CSAIDE 2026)(2026-03-06)

第五届材料工程与应用力学国际学术会议(ICMEAAE 2026)(2026-03-06)

2026年社会心理学、行为科学与教育国际会议(SPBSE 2026)(2026-03-09)

2026年智慧交通与检测技术国际会议(ITDT 2026)(2026-03-25)

2026年第六届智能机器人系统国际会议(ISoIRS 2026)(2026-03-27)

2026年第五届算法、计算和机器学习国际会议(CACML 2026)(2026-03-27)

2026年轨道交通与电气工程国际会议 (ICEERT 2026)(2026-3-25)

2026年互联网金融与数字化社会国际会议(ICIFDS 2026)(2026-2-12)

2026年城市建设与建筑学国际学术会议(ICUCA 2026)(2026-3-18)

2026年机械工程、建模与仿真技术国际会议(ICMEMST 2026)(2026-2-24)

2026年第三届图像处理与人工智能国际会议 (IPAI 2026)(2026-6-10)

2026年网络通信技术与信号处理国际会议(NCISP 2026)(2026-3-26)

2026计算机科学、运输与交通工程国际会议(ICCSTTE 2026)(2026-3-25)

2026年数字信号处理与光纤通信国际会议(ICDSPOC 2026)(2026-2-11)

2026智慧物流、轨道交通与大数据国际会议(SLRTBD 2026)(2026-2-12)

2026公共关系与文化交流、传播国际学术会议(ICPRCEC 2026)(2026-2-15)

小贴士:学术会议云是学术会议查询检索的第三方门户网站。它是会议组织发布会议信息、众多学术爱好者参加会议、找会议的双向交流平台。它可提供国内外学术会议信息预报、分类检索、在线报名、论文征集、资料发布以及了解学术资讯,查找会服机构等服务,支持PC、微信、APP,三媒联动。