- 一般的投稿流程 56
- 在撰写开题报告时需要注意的事项 50
- 关于机电科技方向论文题目借鉴及期 64
- 出版社出书征稿类型是否有限制 60
- 双高、双效、双奖、双百期刊指的是 76
- 介绍产品设计优秀论文题目有哪些? 58
- 有关代数学优秀论文题目有哪些 50
- .《医药论坛杂志》期刊的主题范围 41
- 关于中医外科学方向论文题目借鉴及 65
- 学术会议具有的特征 56
- 论文查重中脚注算不算重复率? 84
- 期刊论文什么时候可以查重啊 50
- wiley的期刊哪些比较好 40
- 被SCI四区收录的药剂科学期刊有 56
- 惊爆!国际知名医学《英国医学杂志 50
- 武汉华联帕博文化传播有限公司 1400
- 北京富来宫温泉山庄 1390
- 安诺优达基因科技(北京)有限公司 7382
- 上海诗成文化发展有限公司 23414
- 个人 23387
- 化工有限公司 17383
- 中国科学院光电技术研究所 17393
- 百奥泰WCO-2015 22370
- 香港教育学院 22438
- 四川大学网络空间安全研究院 22419
- 南京八古堂文化发展有限公司 23404
- 生物医学工程与生物技术组委会 22420
- 安农大生科院 23394
- 北京恒基雅泰咨询服务中心 22406
- 中科院自动化所 17420
- 北京邮电大学 17406
- 凯乐会展(上海)有限公司 7391
- 中山大学南校区 17401
- 上海博勘商务咨询有限公司 7463
- 河南省商丘市化妆品 22407
清华大学 生命学院方晓峰与邓海腾合作鉴定植物中具有相分离潜力的蛋白质
2024/04/18
生物大分子凝聚体(Biomolecular condensates)是细胞内生物大分子(如蛋白质、核酸等)通过相分离(phase separation)形成的无膜细胞器,在细胞生命活动中起着至关重要的作用。过去十多年,生物大分子相分离的研究主要集中于动物和酵母体系,植物相分离蛋白的研究起步较晚,我们对具有潜在相分离能力的蛋白知之甚少。
蛋白的固有无序区(Intrinsically disordered region, IDR)又被称为低复杂度结构域(low complexity domain, LCD),通常富含特定的氨基酸残基,例如极性、芳香族和/或带电氨基酸,具有高度的构象灵活性,易于提供分子间/分子内多价的弱相互作用,是驱动蛋白相分离的重要因素。小分子化合物b-isox(biotinylated isoxazole)可以在低温下形成微晶体,促使LCD蛋白在其表面组装,从而特异富集这些蛋白。
图1.(A)基于b-isox鉴定相分离蛋白的流程图。(B)韦恩图显示从拟南芥幼苗和花组织中鉴定到的具有相分离潜力的蛋白。(C)韦恩图显示从拟南芥在不同胁迫条件下鉴定到的具有相分离潜力的蛋白。(D)不同物种中鉴定得到的具有相分离潜力的蛋白的情况。Cr代表衣藻;Pp代表小立碗藓;Os代表水稻;Ta代表小麦;Zm代表玉米;At代表拟南芥;Br代表白菜;Sl代表番茄
清华大学生命学院方晓峰助理教授和邓海腾教授研究组合作,首先从拟南芥的幼苗和花组织中的细胞裂解液中鉴定到985个具有相分离潜力的蛋白,命名为ProX(Proteins enriched by b-isox)(图1A和B)。ProX列表几乎囊括了大部分目前植物中已被报道可以相分离的蛋白。为了高效地验证候选蛋白的相分离能力,研究团队利用酵母系统异源表达ProX中70个RBPs(RNA-binding protein)蛋白,其中67%都可以形成明显的凝聚体,其余的RBPs在热激胁迫下也能形成凝聚体。说明该研究建立的方法能够高效地鉴定和验证候选的相分离蛋白。
该研究进一步鉴定了拟南芥在不同胁迫处理条件下的相分离蛋白,包括渗透胁迫(250mM山梨糖醇)、盐胁迫(150mM NaCl)、热胁迫(37°C)和氧化胁迫(10mM H2O2)的ProX。结果显示,大约25%的蛋白为各种胁迫条件所特异富集的(图1C)。
除了拟南芥,该研究还鉴定了其他具有代表性的七个物种中的相分离蛋白(图1D)。这一方面将为这些物种中相分离的功能研究提供资源,另一方面有助于从进化角度理解相分离的生物学意义。这些物种的ProXs多种序列比对分析结果表明,尽管IDR的序列差异大,但是在各物种中的存在是保守的,表明相分离的能力在进化上可能是被正向选择的。
综上所述,该研究利用大规模、高通量的蛋白质组学技术,同时建立高通量的检验蛋白相分能力的体系,筛选和鉴定了八种植物的相分离蛋白组,为研究植物中生物大分子相分离的功能奠定基础。
该研究于11月25日在《分子植物》(Molecular Plant)期刊上发表,题为“半体外大规模鉴定植物中具有相分离潜力的蛋白”(Large-scale identification of potential phase separation proteins from plants using a cell-free system)。
清华大学生命学院博士后张红红、科研助理彭方玉、2021级博士生何春以及博士后刘岩为本文共同第一作者,生命学院方晓峰助理教授和邓海腾教授为共同通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金委和北京市自然科学基金委的经费支持。
文章来源清华大学新闻,分享只为学术交流,如涉及侵权问题请联系我们,我们将及时修改或删除。
浙江大学控制科学与工程学院及浙江大学在微型智能空中机器人集群领域取得进展
化学学院裴坚课题组提出理解共轭高分子主链与侧链结晶的新概念——缓冲链模型
医学院程功团队合作发现一种血糖相关代谢小分子可有效阻抑新冠感染重症
我国学者与海外合作者在便携式新冠病毒变异监测研究方面取得进展
第四届计算机图形学、图像与虚拟化研究国际会议(ICCGIV 2024)(2024-05-17)
第九届机电控制技术与交通运输国际学术会议(ICECTT 2024)(2024-05-24)
2024年教育政策与实践研讨会(ICEPP 2024)(2024-05-24)
第三届机电一体化与机械工程国际会议(ICMME2024)(2024-05-24)
2024年电子器件、传感控制技术与光学机械工程国际学术会议(EDSCTOE 2024)(2024-05-25)
第十四届地质和地球物理学国际会议(ICGG 2024)(2024-05-31)
2024年食品工程与农业科学国际会议(ICFEAS 2024)(2024-06-02)
2024年第三届网络、通信与信息技术国际会议(CNCIT 2024)(2024-06-07)
第十届机械工程、材料和自动化技术国际会议(MMEAT 2024)(2024-06-21)
2024年先进机器人,自动化工程与机器学习国际会议(ARAEML 2024)(2024-06-28)
2024年桥梁、隧道与建筑工程国际会议(ICBTCE 2024)(2024-6-22)
2024机械工程、材料科学与力学国际会议(IMES 2024)(2024-5-28)
2024年第四届电力系统与绿色能源大会(PSGEC 2024)(2024-8-22)
2024年半导体、力学与物理学国际会议(ICSMP 2024)(2024-5-25)
2024数字信号处理与天文学国际学术会议(ICADSP 2024)(2024-5-26)
2024年第十三届经济与金融研究国际会议(ICEFR 2024)(2024-5-28)
2024年第七届计算智能与智能系统国际会议(CIIS 2024)(2024-11-22)
2024年数据建模,计算机仿真与信息技术国际会议(DMCSIT 2024)(2024-6-22)
2024年哲学与社会科学国际会议(ICPSS 2024)(2024-6-26)
2024智能电网、电力系统与可持续发展国际会议(SGPSSD2024)(2024-7-23)