- 合编8万字的专著是否符合评职称的 72
- 被El检索到的会议是否意味着其含 53
- 分享农学领域sci期刊有哪些 67
- 如何确定一个期刊是否为SCI(S 71
- 分享运动生物化学方向优秀论文题目 47
- 关于校本教材对于评职称的影响力度 79
- 培训会议的重点难点有哪些 85
- 学术会议质量可以细分的三个维度 57
- 查SCI期刊评职称是否管用的方法 49
- 怎么发表核心期刊论文? 64
- 对于电子书籍来说,ISBN号是否 63
- 国内专利和国外专利哪个申请快呢? 68
- 关于思维导图英语教学论文题目 74
- 论文量大的sci期刊跟容易发表是 67
- 浅析酒店管理专业毕业论文考核评价 42
- 燕山大学 23387
- 扬州大学信息工程学院 17398
- 深圳市泰辰置业顾问有限公司 17400
- 江南大学 7375
- 科技发展与服务中心 23382
- 全国高管委细胞应用管理专业委员会 1396
- 正兴车轮集团有限公司 17398
- 河南师范大学 1396
- 中国疾病预防控制中心性病控制中心 22377
- 合肥南辰数字科技有限公司 7401
- 西安交通大学材料学院 17412
- 北京市海淀人-机-环境系统工程研 20403
- WILL 7368
- EW 7415
- 沈阳市仪器仪表与自动化学会 22404
- 温故知新(上海)教育科技有限公司 7376
- 中育心理 1381
- East Asia Resear 20371
- 北京亿洋天成国际会展有限公司 23423
- 北京交通大学 22449
北大-清华生命学院吴虹课题组与合作者揭示T细胞急性淋巴细胞白血病高危致病基因HOXA13激活的三维基因组调控机制
2024/05/08
T细胞急性淋巴细胞白血病(T-Lineage Acute Lymphoblastic Leukemia, T-ALL)是血液系统常见的恶性肿瘤。虽然联合化疗大大改变了T-ALL的疗效,但仍有20%的儿童和50%的成人T-ALL患者死于这种疾病。近期对T-ALL队列的外显子组及转录组测序鉴定出一系列T-ALL驱动基因及信号通路异常,大大推动了对T-ALL病理机制的了解。然而上述研究都局限于编码序列,考虑到T-ALL的基因突变显著低于其它癌症,寻找基因组非编码区突变及基因组结构变异是研究T-ALL分子机制的重要方向。北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心吴虹教授、清华大学张奇伟教授与北京大学人民医院血液科主任、北大-清华生命科学联合中心黄晓军教授研究团队合作应用Hi-C技术检测中国人群T-ALL基因组三维结构。该研究整合病人Hi-C与RNA-seq数据,揭示了染色质结构变化导致高风险致癌转录因子HOXA13激活的分子机制。研究结果于2021年6月17日以“3D Genome Alterations Associated with Dysregulated HOXA13 Expression in High-Risk T-Lineage Acute Lymphoblastic Leukemia”为题在线发表在Nature Communications。
通过比对T-ALL与正常T细胞之间的三维基因组和基因表达差异,研究者发现T-ALL中29%的差异表达基因存在不同尺度基因组三维结构变化,提示T-ALL基因组三维结构改变同基因表达差异密切相关。研究人员同时在14例病人样本中检测到46个染色体易位事件,其中34个为首次报道,47%的相关断点处于非编码区。在检测出染色体易位的病人样本中,染色体易位都直接导致了致癌转录因子的异常表达,说明染色体易位是T-ALL的最主要驱动因素。研究人员继而对导致致癌转录因子HOXA13表达的染色体易位事件进行了深入分析,发现染色体易位通过两种方式改变HOXA13处的基因组结构并激活其表达:一类染色体易位通过形成的融合蛋白结合于HOXA13的调控元件,激活HOXA13增强子,导致HOXA13表达;另一类则通过“增强子劫持”(enhancer hijacking)激活HOXA13表达。他们结合临床数据及外显子组数据分析发现,HOXA13的表达同T-ALL病人的不良预后相关,HOXA13阳性病人更富集JAK-STAT通路突变,提示临床检测HOXA13表达可以帮助鉴别T-ALL易复发病人,HOXA13阳性病人可能会得益于JAK-STAT通路抑制剂治疗。
染色体易位导致HOXA13激活的分子机制示意图
综上所述,该研究基于Hi-C测序数据,结合RNA-seq、ATAC-seq及H3K27acChIP-seq等多组学数据,以高分辨率刻画了T-ALL中基因同调控元件相互作用图谱,首次揭示了基因组三维结构改变导致HOXA13在T-ALL中异常表达的机制,提示HOXA13的表达可以作为T-ALL预后标志物。该研究对理解T-ALL发病的分子机制与T-ALL靶向治疗都具有重要意义和价值,也为其它癌症的三维基因组研究提供了范式。
吴虹、张奇伟和黄晓军为本文的共同通讯作者。吴虹课题组杨璐助理研究员、张奇伟课题组博士研究生陈凤玲和吴虹课题组博士研究生祝海川为本文共同第一作者。该研究得到北大-清华生命科学联合中心、国家自然科学基金委以及细胞增殖与分化教育部重点实验室的资助。
文章来源北京大学新闻网,分享只为学术交流,如涉及侵权问题请联系我们,我们将及时修改或删除。
物理学院孟杰教授课题组与合作者预言由六个粲夸克组成的双重子系统在强相互作用下存在束缚态
中国中医科学院在娑罗子药效成分生物合成及其机制研究方面取得进展
“可解释、可通用的下一代人工智能方法”重大研究计划系列成果三 ——基于最优传输的神经网络隐式层建模
第四届计算机图形学、图像与虚拟化研究国际会议(ICCGIV 2024)(2024-05-17)
第九届机电控制技术与交通运输国际学术会议(ICECTT 2024)(2024-05-24)
2024年教育政策与实践研讨会(ICEPP 2024)(2024-05-24)
第三届机电一体化与机械工程国际会议(ICMME2024)(2024-05-24)
2024年电子器件、传感控制技术与光学机械工程国际学术会议(EDSCTOE 2024)(2024-05-25)
第十四届地质和地球物理学国际会议(ICGG 2024)(2024-05-31)
2024年食品工程与农业科学国际会议(ICFEAS 2024)(2024-06-02)
2024年第三届网络、通信与信息技术国际会议(CNCIT 2024)(2024-06-07)
第十届机械工程、材料和自动化技术国际会议(MMEAT 2024)(2024-06-21)
2024年先进机器人,自动化工程与机器学习国际会议(ARAEML 2024)(2024-06-28)
2024年电力、智能电网与绿色能源国际会议(ICESGGE 2024)(2024-5-25)
2024年第六届国际大数据工程大会(BDE 2024)(2024-7-24)
2024地理科学与地质勘察国际会议(ICGSGE 2024)(2024-7-27)
2024可持续发展与电力系统、能源国际会议(ICSDPSE 2024)(2024-7-23)
2024年第二届管理创新与经济发展国际学术会议(MIED 2024)(2024-6-28)
2024年第17届计算机科学与信息技术国际会议(ICCSIT 2024)(2024-10-23)
2024年电子信息工程与数字通信国际学术会议(EIEDC 2024)(2024-5-25)
2024年智能驾驶与交通运输国际学术会议(ICIDT 2024)(2024-6-22)
2024年大数据经济与市场金融国际学术会议(ICBDEMF 2024)(2024-6-30)
2024年创意产业与知识经济国际学术会议(CIKE 2024)(2024-6-25)